附子是有毒性的，主要表现为心肌损害引起心律紊乱。根据《内经》“大毒治病，十去其六”之旨，附子确实不宜久服。但实际上附子经过严格的炮制，特别是给予先煎、久煎之后，其毒性大部分已被破坏，而其治疗作用依然存在。比如云南、四川一带不少居民，到冬天常用大量的附子煮肉吃，他们对附子就有较大的耐受性。阳虚体质的人虽久服附子，也很少有毒副反应。因此，附子应用的久暂问题，还与地区、体质等有关。
有人认为附子性温大热，故冬令天寒用之适宜，夏日天热用热药就不合适。其实，正如冬天可以用寒凉药一样，夏天也可用温热药，该用就用，所谓“有故无殒”也。如夏日伤暑大汗出，必然伤气，甚至亡阳，此时就须用附子。总之，附子的适应范围是很广的，其功用则以扶阳为主。附子不但能去表里沉寒，还能制伏虚火、引火归原；与补气药同用，可追复散失之元阳；与补血药同用能够救阴；与发表药同用能开腠理；与利湿药同用则化水湿；与清热药同用，可泻火而调阴阳。
因此，对于典型的阳虚病人，当用附子者，自必用之；对附子可用可不用的，只要无特别禁忌证，也可以用，若确属附子禁忌证范围的，则不宜用。
附子温补命门之火，温里回阳。对脾肾阳虚，久泻不止，服理中汤疗效不显时，将汤中干姜易炮姜用，加熟附片温肾门暖土，则内寒寒湿消除，虚寒泄泻易止。一般常用熟附片10~12g先煎，加党参、焦白术、炮姜、炙甘草，独重附子用量，治在下焦，此所谓“补脾不如补肾也。”
附子暖五脏，回阳气，引火归原，制伏虚热，一定要用的及时。任何疾病濒临汗脱险境，是亡阳抑或亡阴，往往难以卒断，若阴液随汗而亡，误用附子，无异“解径救足”。亡阳者身凉，汗出稠黏如膏，汗冷，尝之味淡，身恶寒，气息微，手足厥逆而舌润，脉微，或浮数而空，用药宜热，用附子10~15g，配红参、山萸肉、干姜、炙甘草之类；若亡阳并有亡阴动象者，可用六味回阳饮——附子加干姜、炙甘草、人参、熟地黄、当归，刚柔相济，以救脱证。
现代西医所谓雷诺症，类似中医“血痹”、“四逆”证，双手苍白可转青或紫暗，手指麻木疼痛，四末冰冷，严冬指端乌紫或呈蜡黄色，疼痛加剧。当用当归四逆汤治疗，偶有不效者，加熟附片、木香二味，疗效即著。