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发布时间 :2023-12-03 20:25:04
发高分文章,让转录组测序成为你的秘密武器
对于课题的开展,还没有明确的方向,要不先来测个序吧~为什么要研究转录组学?每个细胞中包含有很多遗传信息,但是这些遗传信息只有一部分会被表达,在表达的过程中就会产生mRNA转录本(衡量基因表达量的指标),进而我们通过高通量测序就能得知,哪些基因是活跃可以表达的,并产生了多少转录本。
转录组:广义上指某一生理条件下,细胞内所有转录产物的集合,包括mRNA、
rRNA、tRNA以及其他非编码RNA,狭义上的转录组指的是所有mRNA的集合。
在原核生物中,mRNA只占全部RNA的2-5%,其余绝大部分是rRNA,因此若要测mRNA,首先必须先将mRNA纯化出来,然而,原核生物并不像真核生物mRNA具有polyA的结构,因此,无法直接利用 Oligo(dT)将mRNA纯化出来,如果拿total RNA进行测序,那么测序的效率一定会非常差,因为大部分的序列都来自rRNA。目前,提高原核生物中mRNA的量,最主要的方式是去除total
转录组测序:转录组测序指利用高通量测序技术,全面快速获取某一物种特定组织或器官在某一状态下的几乎所有转录本,主要包括mRNA和非编码RNA的序列信息
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